Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms