Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP1Q13835 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms