Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms