Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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