Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
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