Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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