Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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