Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTA1Q13424 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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