Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
UBE2V1Q13404 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms