Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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