Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A2Q12908 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms