Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BPTFQ12830 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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