Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RAB40BQ12829 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB40BQ12829 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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