Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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