Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SREBF2Q12772 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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