Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCDQ05655 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms