Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms