Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP27A1Q02318 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP27A1Q02318 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms