Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms