Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC5Q00444 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms