Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3AP98173 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms