Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM4P67936 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms