Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS25P62851 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS25P62851 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS25P62851 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS25P62851 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS25P62851 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS25P62851 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS25P62851 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms