Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP46P62068 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP46P62068 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP46P62068 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP46P62068 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP46P62068 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP46P62068 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP46P62068 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP46P62068 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP46P62068 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP46P62068 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP46P62068 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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