Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VBP1P61758 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VBP1P61758 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VBP1P61758 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VBP1P61758 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VBP1P61758 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VBP1P61758 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VBP1P61758 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VBP1P61758 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms