Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB2AP61019 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms