Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTBP60709 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTBP60709 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTBP60709 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms