Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms