Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms