Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms