Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATN1P54259 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATN1P54259 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATN1P54259 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms