Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 ATP3YBR039W 936 nt2.37□□□□□ -2.03
SEH1P53011 SHS1YDL225W 1656 nt2.37□□□□□ -2.03
SEH1P53011 PCK1YKR097W 1650 nt2.37□□□□□ -2.03
SEH1P53011 SEC26YDR238C 2922 nt2.37□□□□□ -2.03
SEH1P53011 RTT10YPL183C 3042 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 KAR9YPL269W 1935 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 MAL33YBR297W 1407 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 ISW1YBR245C 3390 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 SMY2YBR172C 2223 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YDL163WYDL163W 303 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YGR293CYGR293C 462 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 PEX18YHR160C 852 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 CKA1YIL035C 1119 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YIL082WYIL082W 873 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 MIX23YBL107C 591 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 snR191snR191 274 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 VPS41YDR080W 2979 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 PTP3YER075C 2787 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 UBP15YMR304W 3693 nt2.36□□□□□ -2.03
SEH1P53011 APC2YLR127C 2562 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 PRE1YER012W 597 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 TDA2YER071C 381 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 NOP19YGR251W 591 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YKL066WYKL066W 444 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 CWC24YLR323C 780 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YMR187CYMR187C 1296 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 RRT16YNL105W 429 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YBL108WYBL108W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 CSM4YPL200W 471 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YPR153WYPR153W 423 nt2.35□□□□□ -2.03
SEH1P53011 TOP2YNL088W 4287 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 HAA1YPR008W 2085 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 RLI1YDR091C 1827 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 DAD1YDR016C 285 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YAP5YIR018W 738 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YLR271WYLR271W 825 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YNL235CYNL235C 432 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 COQ10YOL008W 624 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YAP7YOL028C 738 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 YBR051WYBR051W 351 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 MUD1YBR119W 897 nt2.34□□□□□ -2.03
SEH1P53011 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.34□□□□□ -2.04
SEH1P53011 NUM1YDR150W 8247 nt2.34□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YPK1YKL126W 2043 nt2.34□□□□□ -2.04
SEH1P53011 ORC2YBR060C 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 RPN3YER021W 1572 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 GIN4YDR507C 3429 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 snR9snR9 187 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YDR018CYDR018C 1191 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 SRP21YKL122C 504 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 RPS1AYLR441C 768 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 GMC2YLR445W 567 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 CSI1YMR025W 888 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 MFB1YDR219C 1398 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 SRO77YBL106C 3033 nt2.33□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YBT1YLL048C 4986 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 SCY1YGL083W 2415 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 ALY1YKR021W 2748 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YEL057CYEL057C 702 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YMR31YFR049W 372 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 EMC6YLL014W 327 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 PAU23YLR037C 375 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 PDP3YLR455W 915 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 FPR1YNL135C 345 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YNL150WYNL150W 408 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 HEM4YOR278W 828 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YPR014CYPR014C 330 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YPR170CYPR170C 336 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YDR186CYDR186C 2634 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 TMA20YER007C-A 546 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 VMA21YGR105W 234 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YJR087WYJR087W 351 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YAL037WYAL037W 804 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YOL134CYOL134C 390 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 PDR1YGL013C 3207 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 UTP15YMR093W 1542 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 SIR3YLR442C 2937 nt2.31□□□□□ -2.04
SEH1P53011 SPB1YCL054W 2526 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 FAR7YFR008W 666 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 MRP49YKL167C 414 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 IRC21YMR073C 606 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 FUS1YCL027W 1539 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 SSP1YHR184W 1716 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YRR1YOR162C 2433 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 DNL4YOR005C 2835 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YIL080WYIL080W 4722 nt2.3□□□□□ -2.04
SEH1P53011 NPR3YHL023C 3441 nt2.29□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YCR090CYCR090C 549 nt2.29□□□□□ -2.04
SEH1P53011 OCA6YDR067C 675 nt2.29□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YDR115WYDR115W 318 nt2.29□□□□□ -2.04
SEH1P53011 NCB2YDR397C 441 nt2.29□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.29□□□□□ -2.04
SEH1P53011 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.7 ms