Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms