Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERFP50548 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERFP50548 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERFP50548 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERFP50548 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERFP50548 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERFP50548 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms