Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRIP1P50238 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms