Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK2P49760 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK2P49760 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK2P49760 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLK2P49760 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLK2P49760 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK2P49760 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms