Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMAN1P49257 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms