Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms