Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms