Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATRXP46100 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATRXP46100 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATRXP46100 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms