Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFMP43652 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFMP43652 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFMP43652 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFMP43652 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFMP43652 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFMP43652 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFMP43652 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms