Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms