Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN7P41732 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms