Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF9P41273 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms