Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP8P40818 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP8P40818 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP8P40818 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP8P40818 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP8P40818 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP8P40818 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP8P40818 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms