Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHMBP2P38935 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHMBP2P38935 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms