Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms