Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGCXP38435 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GGCXP38435 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GGCXP38435 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGCXP38435 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms