Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCA1P38398 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCA1P38398 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms