Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms